| TFBIND | |
| Categories | 配列モチーフ解析 | モチーフ検索 核酸配列解析 | 転写因子結合サイトの抽出・検索 ホモロジー検索 |
| Name | TFBIND |
| Availability | WWW |
| Provider | HGC |
| Keywords | 重み行列 |
| Feature | 重み行列に独自の閾値を用いた転写因子結合部位(TATA box, GC box, CCAAT box, 転写開始部位(TSS)を含む）検索のためのソフトウェア。アルゴリズムは、転写因子結合部位の局所的な過剰表現を発見し、結合スコアの最適な閾値を決定する。この最適値とWingender博士らによる転写因子データベースTRANSFAC R.3.4を用いて、 ゲノムDNA中の転写因子結合部位を（特に主要な結合配列については）高い精度で発見することができる。 |
| Reference | Estimating transcription factor bindability on DNA. Tsunoda T, Takagi T. Bioinformatics. 1999 Jul-Aug;15(7-8):622-30. PubMed ID: 10487870 Link to Google Scholar |
| Last Updated | - |