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TFSEACH
Categories 配列モチーフ解析 | モチーフ検索
核酸配列解析 | 転写因子結合サイトの抽出・検索
ホモロジー検索
Name TFSEACH
Availability WWW
Provider CBRC
Keywords プロファイル
Feature DNAへの転写因子の結合部位予測。
与えられたDNA上を走査し、結合部位プロファイル行列との相関度の高い領域を報告する。結合部位プロファイル行列として、TFMATRIXデータベースを利用している。 TFMATRIXは、ドイツのGBF-Braunschweig研究所で開発されたTRANSFACデータベース群に収容されているデータベースの一つである。
Reference TFSEARCH: Searching Transcription Factor Binding Sites.
Yutaka Akiyama.
Bioinformatics. 1999 Jul-Aug;15(7-8):622-30.
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Last Updated 1998-04-01