TFSEACH | |
Categories | 配列モチーフ解析 | モチーフ検索 核酸配列解析 | 転写因子結合サイトの抽出・検索 ホモロジー検索 |
Name | TFSEACH |
Availability | WWW |
Provider | CBRC |
Keywords | プロファイル |
Feature | DNAへの転写因子の結合部位予測。 与えられたDNA上を走査し、結合部位プロファイル行列との相関度の高い領域を報告する。結合部位プロファイル行列として、TFMATRIXデータベースを利用している。 TFMATRIXは、ドイツのGBF-Braunschweig研究所で開発されたTRANSFACデータベース群に収容されているデータベースの一つである。 |
Reference | TFSEARCH: Searching Transcription Factor Binding Sites. Yutaka Akiyama. Bioinformatics. 1999 Jul-Aug;15(7-8):622-30. Link to Google Scholar |
Last Updated | 1998-04-01 |