| HMMER | |
| Categories | 配列モチーフ解析 | モチーフ検索 配列モチーフ解析 | モチーフ抽出 ホモロジー検索 |
| Name | HMMER |
| Availability | Download |
| Provider | WUSTL |
| Keywords | HMM |
| Feature | アミノ酸のコンセンサス配列をHMM形式に変換し検索するためのパッケージである。 マルチプルアライメントからHMMを生成するプログラム・入力されたアミノ酸配列とHMMとをアライメントするプログラムから構成される。 |
| Reference | The theory behind profile HMMs R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh, and G. Mitchison. Biological sequence analysis: probabilistic models of proteins and nucleic acids, Cambridge University Press, 1998. Link to Google Scholar |
| Last Updated | 2010-03-28 |