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SignalP
Categories タンパク質配列解析・プロテオミクス | 細胞内局在予測
Name SignalP
Availability WWW
Provider CBS
Keywords シグナル配列
HMM
ニューラルネットワーク
Feature アミノ酸配列中のシグナル配列の局在部位とその切断部位を予測するツール。対象生物は、グラム陽性菌、グラム陰性菌、真核生物。アルゴリズムに隠れマルコフモデル(HMM)とニューラルネットワークを選択することができる。
Reference Identification of prokaryotic and eukaryotic signal peptides and prediction of their cleavage sites.
Nielsen H, Engelbrecht J, Brunak S, von Heijne G.
Protein Eng. 1997 Jan;10(1):1-6.
PubMed ID: 9051728
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Last Updated 2011-10-26