MUMmer | |
Categories | 配列比較解析 | ゲノムスケール配列アライメント |
Name | MUMmer |
Availability | Download |
Provider | TIGR |
Keywords | ゲノム アライメント 接尾辞木 |
Feature | 接尾辞木(suffix tree)データ構造と線形時間アルゴリズムを用いて、ゲノム配列などの長い配列のアライメントを高速に行うツール。 |
Reference | Alignment of whole genomes. Delcher AL, Kasif S, Fleischmann RD, Peterson J, White O, Salzberg SL.. Nucleic Acids Res. 1999 Jun 1;27(11):2369-76. PubMed ID: 10325427 Link to Google Scholar |
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