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MUMmer
Categories 配列比較解析 | ゲノムスケール配列アライメント
Name MUMmer
Availability Download
Provider TIGR
Keywords ゲノム
アライメント
接尾辞木
Feature 接尾辞木(suffix tree)データ構造と線形時間アルゴリズムを用いて、ゲノム配列などの長い配列のアライメントを高速に行うツール。
Reference Alignment of whole genomes.
Delcher AL, Kasif S, Fleischmann RD, Peterson J, White O, Salzberg SL..
Nucleic Acids Res. 1999 Jun 1;27(11):2369-76.
PubMed ID: 10325427
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