| MUSCLE | |
| Categories | 進化解析 | マルチプルアライメント 配列比較解析 | マルチプルアライメント |
| Name | MUSCLE |
| Availability | WWW Download |
| Provider | UCB | EBI |
| Keywords | - |
| Feature | アミノ酸配列のマルチプルアライメントを行うツール。まず、k-tupleに基づく距離の計算を行い、アライメントのペアを求める。次に、そのペアに対して距離の再計算を行い、平均距離法（UPGMA）により、系統樹を作成する。最後に最適のSPスコアを与えるように部分系統樹の再構成アライメントを繰り返す。全てのペアワイズアライメントを求めないため、処理が高速である。 |
| Reference | MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput. Edgar RC. Nucleic Acids Res. 2004 Mar 19;32(5):1792-7. Print 2004. PubMed ID: 15034147 Link to Google Scholar |
| Last Updated | 2010-05-01 |