| ARLEQUIN | |
| Categories | 遺伝統計解析 | ハプロタイプ・連鎖不平衡解析 | ハプロタイプ推定 遺伝統計解析 | データの品質管理 | Hardy-Weinberg平衡検定など |
| Name | ARLEQUIN |
| Availability | Download |
| Provider | Univ. of Geneva |
| Keywords | ハプロタイプ推定 EMアルゴリズム Hardy-Weinberg平衡 連鎖不平衡解析 |
| Feature | ハプロタイプ推定関連の機能をまとめたソフトウェアである。家系情報のない多数個体の遺伝子型データからEMアルゴリズムを用いた最尤法により集団のハプロタイプ頻度を推定する。特定集団におけるHardy-Weinberg平衡の検定、連鎖不平衡尺度の計算なども可能であり、複数集団におけるハプロタイプを用いた解析手法も提供している。Java言語で記載されている。 |
| Reference | - |
| Last Updated | 2007-02-17 |