| Cluster Buster | |
| Categories | 配列モチーフ解析 | モチーフ検索 核酸配列解析 | 転写因子結合サイトの抽出・検索 ホモロジー検索 |
| Name | Cluster Buster |
| Availability | WWW Download |
| Provider | BU |
| Keywords | CRM HMM |
| Feature | DNA配列中のcis-regulatory modules (CRMs)を検索するツール。入力するモチーフは重み行列である。HMMを用いて最良のモチーフのクラスターをもつwindowを求める。HMMの問題点を解消するために、スコアを工夫している。 |
| Reference | Cluster-Buster: Finding dense clusters of motifs in DNA sequences. Frith MC, Li MC, Weng Z. Nucleic Acids Res. 2003 Jul 1;31(13):3666-8. PubMed ID: 12824389 Link to Google Scholar |
| Last Updated | 2009-08-16 |