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Parallel PRRN
Categories 進化解析 | マルチプルアライメント
配列比較解析 | マルチプルアライメント
Name Parallel PRRN
Availability WWW
Provider HGC
Keywords 累進法
反復改善法
Feature 累進法と反復改善法を組み合わせたマルチプルアライメントツール。
累進法には入力配列群の中に配列類似性の低い配列が入り込んでいるとうまくマルチプルアライメントを生成できない欠点がある。それを克服するため、累進法におけるアライメント同士を組み上げる過程に反復改善法を導入している。累進法のみの手法より計算時間がかかる。
Reference Multiple sequence alignment: algorithms and applications.
Gotoh O.
Adv Biophys. 1999;36:159-206. Review.
PubMed ID: 10463075
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