生命科学系主要プロジェクト一覧

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統合データベースプロジェクト
プロジェクト名 統合データベースプロジェクト
開始年度 2006
終了年度 2010
期間 -
予算額 2.9億円(2006年度)
16億円(2007年度)
11億円(2008年度)
9億円(2009年度)
3.8億円(2010年度)
主要研究者(プロジェクト当時の所属機関) 代表研究者:高木 利久(ライフサイエンス統合データベースセンター)
●中核機関 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
(研究参画機関)
 ・科学技術振興機構
 ・産業技術総合研究所生命情報工学研究センター
 ・かずさDNA研究所
 ・九州大学
 ・奈良先端科学技術大学院大学
 ・長浜バイオ大学
 ・東京大学
 ・お茶の水女子大学
●分担機関(医療に関わるデータベースの統合化)代表者
 ・金久 實 (京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター)
 ・田中 博 (東京医科歯科大学情報医科学センター)
 ・徳永 勝士 (東京大学大学院医学系研究科)
●補完課題を実施する機関の代表者
 ・豊田 哲郎(理化学研究所)
 ・成松 久(産業技術総合研究所)
 ・五條堀 孝(国立遺伝学研究所)
 ・皿井 明倫(九州工業大学)
概要 生命科学分野DB戦略立案支援、ポータルサイト整備
プロジェクトの概要 文科省統合データベースプロジェクトのページ( http://lifesciencedb.mext.go.jp/project/index.html )より引用
 生命情報の統合化データベースはライフサイエンス研究を支える基盤であり、その整備を進めるために必要な戦略の検討と技術開発を行なうため、「統合データベースプロジェクト」を推進する。本事業では、我が国のライフサイエンス関係のデータベースの利便性の向上を図るため、我が国のライフサイエンス関係データベース整備戦略の立案・評価支援、データベース統合化の基盤技術開発、ポータルサイトの整備等を行い、統合化を推進する。
主要事業内容(DBCLSによるまとめ) ・中核的機関整備(ライフサイエンス統合データベースセンター)による総合的推進
・統合データベースの開発、運営
・文献情報との連携やデータへの注釈付加
・分担機関(東大、東京医科歯科大、京大)による化合物・医薬品、臨床・疾患等の医療に関わるデータベースの統合化
・補完課題を実施する機関(理化学研究所、産業技術総合研究所、国立遺伝学研究所、九州工業大学)によるデータベース統合化の加速
・維持困難となった有用データベースの受入
・データベース開発のための人材育成

本プロジェクトは、「ライフサイエンスデータベース統合推進事業」( http://togodb.biosciencedbc.jp/entry/lsdb_project/81 )に引き継がれた。
公開状況 プロジェクト全体のオープンアクセス化を目指す。
データベース公開状況の分類 共有
公開データベース LifeScienceDB( http://lifesciencedb.jp/ )
データダウンロードサイト ・ http://lifesciencedb.jp/?pg=4
・生命科学系データベースダウンロードサービス( http://dbarchive.lifesciencedb.jp/ )
公開ホームページ ・ライフサイエンス統合データベースセンター( http://dbcls.rois.ac.jp/ )
・文科省統合データベースプロジェクト( http://lifesciencedb.mext.go.jp/ )
実施省庁 文部科学省
事業化関連 -
報告書 ・H18成果公開サイト( http://lifesciencedb.jp/MEXT_H18/ )
・文部科学省統合データベースプロジェクト成果のページ( http://lifesciencedb.mext.go.jp/result/index.html )
評価報告書 ・文部科学省統合データベースプロジェクト評価のページ( http://lifesciencedb.mext.go.jp/hyouka/index.html )
・プロジェクト外部評価のページ( http://lifesciencedb.jp/lsdb.cgi?gg=hyouka )
その他文献 ・「生命科学系データベース統合化の背景」蛋白質 核酸 酵素 VOL.52 NO.9
・「統合データベースセンターがめざすもの」蛋白質 核酸 酵素 VOL.52 NO.11
・「医薬品の統合データベース」蛋白質 核酸 酵素 VOL.52 NO.12
・「蛋白質構造情報の高度化と統合データベース」蛋白質 核酸 酵素 VOL.52 NO.14
・「ゲノム情報と統合データベース」蛋白質 核酸 酵素 VOL.52 NO.15
・「ライフサイエンスにおけるデータベース構築のための人材育成」蛋白質 核酸 酵素 VOL.53 NO.1
・「海外データベースとの連携」蛋白質 核酸 酵素 VOL.53 NO.2
・「統合データベースプロジェクトのサービスとその利用法」蛋白質 核酸 酵素 VOL.53 NO.3
・「利用者の立場からのコメント」蛋白質 核酸 酵素 VOL.53 NO.5
・「わが国における疾患データベースの統合化」蛋白質 核酸 酵素 VOL.53 NO.6
・「ゲノムワイド関連解析データベースの開発」蛋白質 核酸 酵素 VOL.53 NO.7
・「『蛋白質 核酸 酵素』バックナンバーの全文検索サービス公開にあたって」蛋白質 核酸 酵素 VOL.53 NO.9
・「統合データベースプロジェクト」週刊医学のあゆみ VOL.223 NO.4