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近隣結合法(NJ法)
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近隣結合法(NJ法)
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進化系統樹を作成するためのボトムアップ式の距離行列法であり段階的探索手法の一つである。
系統樹は無根系統樹と呼ばれる形をしており、段階的に近隣を見出だすと言う方法により、膨大な量の配列でも計算時間は他の方法に比べて少なくてすむという利点がある。分子時計の仮説である、すべての系統が同じ速度で進化するということを仮定せずに系統樹を作成する事が出来るのがUPGMAと違う。