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Needleman-Wunsch
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Needleman-Wunsch
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配列全体の類似性を調べるグローバルアライメントを求めるアルゴリズムで、動的計画法(DynapicPrograming)を用いている。
当初アミノ酸配列の比較のために開発されたアルゴリズムであり、ギャップを含んだ形で最適なアライメントを見つけるが、最長経路が最適なアライメントとするため、他のアルゴリズムに比べて、統計処理をする計算時間がかかってしまうのが難点。