| UPGMA | |
| Keyword | UPGMA |
| Description | UPGMA（unweighted pair group method with arithmetic mean）は平均距離法と呼ばれ、段階的探索法の一種で有根系統樹を作成する方法である。まず、各配列の距離行列を元に最近縁の配列を結合してクラスターを形成し、そのクラスターと他の配列との距離はクラスター内の各配列と対象の配列との距離の平均値とする。次に、距離の近い配列(またはクラスター)同士の結合を繰り返すことで、一つの有根系統樹を作成する。計算は容易であるが、進化速度が一定であると仮定するために系統間で進化速度が異なる場合は誤推定を行ってしまう欠点をもつ。 |