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MEME
Categories 配列モチーフ解析 | モチーフ抽出
核酸配列解析 | 転写因子結合サイトの抽出・検索
Name MEME
Availability WWW
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Provider SDSC
Keywords 有限混合分布モデル
EM法
Feature 有限混合分布モデルによるモチーフを表現し、入力データを基にしてEM法により有限混合分布モデルのパラメータフィッティングを行う。入力配列群はマルチプルアライメントされている必要がないがモチーフの長さを指定しなければならない。
Reference Fitting a mixture model by expectation maximization to discover motifs in biopolymers.
Bailey TL, Elkan C.
l Syst Mol Biol. 994;2:28-36.
PubMed ID: 7584402
Link to Google Scholar
Last Updated 2010-05-14