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PHD
Categories タンパク質配列解析・プロテオミクス | タンパク質二次構造予測
Name PHD
Availability WWW
Provider Columbia Univ.
Keywords マルチプルアライメント
ニューラルネットワーク
Feature マルチプルアライメント結果+ニューラルネットワークを用い、近年まで標準的に用いられてきた比較的精度の良いツール。現在ホモロジー検索・膜貫通領域予測等を含むPredictProteinの中で提供。
配列解析と構造予測のためのウェブサービス。
データベースより似ている配列を検索し、タンパク質構造を推定予測する。
手法としては、FlowChart、Methods & Versions PP、Methods META-PPを使用する。
Reference PHD: predicting one-dimensional protein structure by profile-based neural networks.
Rost B.
Methods Enzymol. 1996;266:525-39.
PubMed ID: 8743704
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Last Updated 2007-10-04