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TopPred
Categories タンパク質配列解析・プロテオミクス | 膜貫通領域予測
Name TopPred
Availability WWW
Provider Pasteur Institute
Keywords positive-insideルール
Feature 細菌のタンパク質を対象とする膜貫通領域予測ツール。
入力配列に対し、在り得る膜貫領域トポロジーを列挙し、細胞質側に正電荷残基が多く存在する性質(positive-insideルール)に対する適合度でトポロジーをランキングする。
Reference Membrane protein structure prediction. Hydrophobicity analysis and the positive-inside rule.
von Heijne G.
J Mol Biol. 1992 May 20;225(2):487-94.
PubMed ID: 1593632
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Last Updated 2007-06-08