AUGUSTUS | |
Categories | 核酸配列解析 | エクソン・イントロン構造予測 | Ab initio法 |
Name | AUGUSTUS |
Availability | WWW Download |
Provider | GOBICS |
Keywords | GHMM |
Feature | GHMMを用いたab intio法による遺伝子領域予測プログラム。特徴量として、コード領域、非コード領域配列、スプライスサイト、ブランチポイント、翻訳の開始と終結、エクソンとイントロンをモデル化している。ヒトをはじめ、植物、菌類に対応している。 |
Reference | Gene prediction with a hidden Markov model and a new intron submodel. Stanke M, Waack S. Bioinformatics. 2003 Oct;19 Suppl 2:II215-II225. PubMed ID: 14534192 Link to Google Scholar |
Last Updated | 2011-03-02 |