Category  ||   Tool  |   How-to  |   Review  ||   Keyword
AUGUSTUS
Categories 核酸配列解析 | エクソン・イントロン構造予測 | Ab initio法
Name AUGUSTUS
Availability WWW
Download
Provider GOBICS
Keywords GHMM
Feature GHMMを用いたab intio法による遺伝子領域予測プログラム。特徴量として、コード領域、非コード領域配列、スプライスサイト、ブランチポイント、翻訳の開始と終結、エクソンとイントロンをモデル化している。ヒトをはじめ、植物、菌類に対応している。
Reference Gene prediction with a hidden Markov model and a new intron submodel.
Stanke M, Waack S.
Bioinformatics. 2003 Oct;19 Suppl 2:II215-II225.
PubMed ID: 14534192
Link to Google Scholar
Last Updated 2011-03-02