| BLAT | |
| Categories | 核酸配列解析 | エクソン・イントロン構造予測 | 転写産物からの推定 核酸配列解析 | ホモロジー検索 タンパク質配列解析・プロテオミクス | ホモロジー検索 ホモロジー検索 配列比較解析 |
| Name | BLAT |
| Availability | www |
| Provider | UCSC |
| Keywords | ローカル探索 ヒューリスティック 高速 核酸 アミノ酸 ゲノム |
| Feature | ヒューリステックなローカルアライメント手法。クエリー、データベースともにk-merに分割することで高速な探索を実現している。核酸、アミノ酸を入力とし核酸、アミノ酸データベースに対する検索が行える。 |
| Reference | BLAT--the BLAST-like alignment tool. Kent WJ. Genome Res. 2002 Apr;12(4):656-64. PubMed ID: 11932250 Link to Google Scholar |
| Last Updated | 2007-04-20 |