CellMontage | |
Categories | マイクロアレイデータ解析 | 発現解析 | データベース検索 |
Name | CellMontage |
Availability | WWW |
Provider | CBRC |
Keywords | 順位相関係数 |
Feature | 発現プロファイルのデータベースに対して類似度検索を実行するツール。ユーザが保有する発現プロファイルデータを問い合わせとして受けつけ、GEOやArrayExpressの発現プロファイルデータに対して検索を実行することが可能。遺伝子のIDをUniGene IDもしくはRefSeqのアクセッション番号に変換することと、順位相関係数を類似尺度に用いることで、計測に用いられたプラットフォームに関係なく、つまりクロスプラットフォームの検索が可能となっている。 |
Reference | CellMontage: similar expression profile search server. Fujibuchi W, Kiseleva L, Taniguchi T, Harada H, Horton P. Bioinformatics. 2007 Nov 15;23(22):3103-4. Epub 2007 Sep 25. PubMed ID: 17895274 Link to Google Scholar |
Last Updated | 2008-07-23 |