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CellMontage
Categories マイクロアレイデータ解析 | 発現解析 | データベース検索
Name CellMontage
Availability WWW
Provider CBRC
Keywords 順位相関係数
Feature 発現プロファイルのデータベースに対して類似度検索を実行するツール。ユーザが保有する発現プロファイルデータを問い合わせとして受けつけ、GEOやArrayExpressの発現プロファイルデータに対して検索を実行することが可能。遺伝子のIDをUniGene IDもしくはRefSeqのアクセッション番号に変換することと、順位相関係数を類似尺度に用いることで、計測に用いられたプラットフォームに関係なく、つまりクロスプラットフォームの検索が可能となっている。
Reference CellMontage: similar expression profile search server.
Fujibuchi W, Kiseleva L, Taniguchi T, Harada H, Horton P.
Bioinformatics. 2007 Nov 15;23(22):3103-4. Epub 2007 Sep 25.
PubMed ID: 17895274
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Last Updated 2008-07-23