| ClustalW | |
| Categories | 進化解析 | マルチプルアライメント 配列比較解析 | マルチプルアライメント |
| Name | ClustalW |
| Availability | WWW Download |
| Provider | EBI | NIG | IGBMC |
| Keywords | 累進法 グローバルアライメント |
| Feature | 累進法によるマルチプルアライメントツール。 NJ法により系統樹を作成し、その系統樹で距離が近い配列同士から累進法によってマルチプルアライメントに組み上げられて行く。 入力された配列群の全ペアを対象としてペアワイズアライメントを行い距離行列を生成し、基にNJ法により系統樹を作成、系統樹の枝に沿ってペアワイズアライメント同士をアライメントすることにより最終的なマルチプルアライメントを生成する。 |
| Reference | CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice. Thompson JD, Higgins DG, Gibson TJ. Nucleic Acids Res. 1994 Nov 11;22(22):4673-80. PubMed ID: 7984417 Link to Google Scholar |
| Last Updated | 2010-06-04 |