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EST_GENOME
Resource Name EST_GENOME
Other Names EST2GENOME
Description EST,cDNA,mRNAの配列をゲノムにマッピングするツールSmith-Watermanを用いているため時間がかかる。
Categories
処理要素別 > 比較する > 配列を比較する > 2つの配列を比較する > 2つの配列の全領域を比較する > グローバルペアワイズアライメント > グローバルペアワイズアライメント(核酸配列 対 核酸配列)
処理要素別 > 同定/予測する > ゲノム配列構造を同定/予測する > 遺伝子コード領域を同定/予測する > 転写産物配列比較により遺伝子コード領域を同定/予測する > ホモロジー検索(核酸配列 対 核酸配列DB) > グローバルペアワイズアライメント(核酸配列 対 核酸配列)
分野別 > ゲノム解析 > アノテーション > コード領域予測 > making human chr21q gene catalog > Step6
分野別 > ゲノム解析 > 比較ゲノム解析 > detecting orthologs of chimp and human > Step8
文献別 > チンパンジー22番染色体ゲノム解読 > making human chr21q gene catalog > [ChimpChr22_Workflow_2_4]
文献別 > チンパンジー22番染色体ゲノム解読 > detecting orthologs of chimp and human > [ChimpChr22_Workflow_3_2]
Websites WTCHG
Reference EST_GENOME: a program to align spliced DNA sequences to unspliced genomic DNA.
PubMed ID: 9283765