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Genscan
Resource Name Genscan
Other Names -
Description 隠れマルコフモデル（HMM）を利用し、与えられた塩基配列から遺伝子領域を予測する。コーディングポテンシャル、スプライスサイト周りなどの塩基配列の特徴量から確率モデルを作成することで遺伝子領域を予測する。脊椎動物、トウモロコシ、シロイヌナズナのモデルが用意されている。
Categories
処理要素別 > 同定/予測する > ゲノム配列構造を同定/予測する > 遺伝子コード領域を同定/予測する > ab initio法により遺伝子コード領域を同定/予測する
分野別 > ゲノム解析 > アノテーション > コード領域予測 > Ab initio法により遺伝子コード領域を同定/予測する > Step1
分野別 > ゲノム解析 > アノテーション > コード領域予測 > Ab initio法により遺伝子コード領域を同定/予測する > Step5
分野別 > ゲノム解析 > アノテーション > コード領域予測 > 遺伝子コード領域を同定/予測する(その2) > Step11 Ab initio法により遺伝子コード領域を同定/予測する
文献別 > シロイヌナズナゲノム解読(遺伝子領域予測) > Ab initio法により遺伝子領域を同定/予測する > Ab initio法により遺伝子領域を同定/予測する
文献別 > シロイヌナズナ1番染色体ゲノム解読(ゲノム解析) > アノテーション > 遺伝子領域予測 > Ab initio法により遺伝子領域を同定/予測する > Ab initio法により遺伝子領域を同定/予測する
文献別 > ヒトゲノム解読(ゲノム解析) > アノテーション > 遺伝子コード領域を同定/予測する(その2) > Ab initio法により遺伝子領域を同定/予測する
文献別 > イネ1番染色体ゲノム解読(ゲノム解析) > RiceGAAS遺伝子領域予測 > Ab initio法により遺伝子領域を同定/予測する
文献別 > イネ1番染色体ゲノム解読(ゲノム解析) > RiceGAAS遺伝子領域予測 > Ab initio法により遺伝子領域を同定/予測する
文献別 > イネ4番染色体ゲノム解読(ゲノム解析) > アノテーション > 遺伝子領域予測 > Ab initio法により遺伝子領域を同定/予測する > Ab initio法により遺伝子領域を同定/予測する
Websites MIT
Reference Prediction of complete gene structures in human genomic DNA.
PubMed ID: 9149143