| InterPro | |
| Resource Name | InterPro |
| Other Names | InterProScan |
| Description | 代表的なアミノ酸配列DB・それらに対する検索ツールがパッケージングされたデータベースである。プロファイル・正規表現のデータベースとしてさPROSITE、HMMのデータベースとしてGene3D,、PANTHER、PIRSF、Pfam、SMART、SUPERFAMILY及びTIGRFAMs、重み行列のデータベースとしてPRINTSが統合されている。WEBサイトには、これらのデータベースに対する一括検索機能が備わっており、入力配列とのアライメント結果・GOターム・生物種間の進化系統関係を得ることができる。 |
| Categories | 処理要素別 > 探索する > 配列データベースから探索する > 配列類似性をもとに探索する > 配列パターン(モチーフ)検索 分野別 > プロテオーム解析 > 機能解析 > プロテオーム解析 > Step19 機能を予測する 文献別 > ヒトゲノム解読(ゲノム解析) > プロテオーム解析 > 機能予測 文献別 > マラリア原虫2番染色体ゲノム解読(ゲノム解析) > 機能予測 > 機能予測 文献別 > イネ1番染色体ゲノム解読(ゲノム解析) > タンパク質機能予測 > 機能予測 |
| Websites | EBI |
| Reference | InterPro, progress and status in 2005. PubMed ID: 15608177 |