| MAST | |
| Resource Name | MAST |
| Other Names | - |
| Description | アミノ酸配列にヒットした複数種類のモチーフから、そのアミノ酸配列が特定タンパク質ファミリーに属することについてのp-valueを算出するプログラムである。1種類のモチーフについて評価より、高精度・高感度な評価をすることが目的である。ユーザは、問い合わせ配列と、特定のタンパク質ファミリーに属するモチーフセットを入力する。モチーフ検索の結果、ヒットしたモチーフの種類毎にp-valueが得られる。その積算値は統計値として取り扱われ、入力配列が特定タンパク質ファミリーに属することについてのp-valueが算出される。このp-value算出には、N個の独立事象が同時に起こる確率を統計値とする確率分布が必要であり、これを高速計算するQFASTと名づけられた独自手法が用いられる。 |
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| Websites | SDSC |
| Reference | Combining evidence using p-values: application to sequence homology searches. PubMed ID: 9520501 |