| PHRAP | |
| Resource Name | PHRAP |
| Other Names | - |
| Description | BAC程度のサイズのゲノムに対するショットガンデータをアセンブルするためのプログラム。非常に広範に用いられている。入力配列断片の全長を用い、Smith-Watermanアルゴリズムによりそれらの重なり合いを計算し、重なり合う断片同士のマルチプルアライメントからコンセンサス配列を生成する。このコンセンサス配列生成の際に配列決定のクオリティー情報が用いられ、より精度の高いコンセンサス配列が生成される。 |
| Categories | |
| Websites | UW |
| Reference | Base-calling of automated sequencer traces using phred. II. Error probabilities. PubMed ID: 9521922 |