| Spidey | |
| Resource Name | Spidey |
| Other Names | - |
| Description | EST,cDNA,mRNAの配列をゲノムにマッピングするツール。BLASTベース。スプライスサイト周辺を、脊椎動物、ショウジョウバエ、線虫、植物それぞれでモデル化。 |
| Categories | 処理要素別 > 探索する > 配列データベースから探索する > 配列類似性をもとに探索する > ホモロジー検索 > ホモロジー検索(核酸配列 対 核酸配列DB) 処理要素別 > 同定/予測する > ゲノム配列構造を同定/予測する > 遺伝子コード領域を同定/予測する > 転写産物配列比較により遺伝子コード領域を同定/予測する > ホモロジー検索(核酸配列 対 核酸配列DB) 分野別 > ゲノム解析 > アノテーション > コード領域予測 > 遺伝子コード領域を同定/予測する(その1) > Step8 ゲノム配列上への既知遺伝子のマッピング 文献別 > ヒトゲノム解読(ゲノム解析) > アノテーション > 遺伝子コード領域を同定/予測する(その1) > ゲノム配列上への既知遺伝子のマッピング |
| Websites | NCBI |
| Reference | Spidey: a tool for mRNA-to-genomic alignments. PubMed ID: 11691860 |