| SSEARCH | |
| Categories | 核酸配列解析 | ホモロジー検索 タンパク質配列解析・プロテオミクス | ホモロジー検索 ホモロジー検索 配列比較解析 |
| Name | SSEARCH |
| Availability | WWW |
| Provider | UVA | HGC |
| Keywords | ローカル探索 Smith-Waterman 核酸 アミノ酸 |
| Feature | Smith-Waterman アルゴリズムが採用された高精度のローカル検索サービスで、塩基配列、アミノ酸配列データーベースにてそれぞれの配列を検索する。計算時間は非常にかかる。 検索対象のデータベースは、DDBJが提供しているデータベースが中心。 |
| Reference | Identification of common molecular subsequences. Smith TF, Waterman MS. J Mol Biol. 1981 Mar 25;147(1):195-7. PubMed ID: 7265238 Link to Google Scholar |
| Last Updated | 2011-02-10 |