| BLAT | |
| Resource Name | BLAT |
| Other Names | - |
| Description | ヒューリステックなローカルアライメント手法。クエリー、データベースともにk-merに分割することで高速な探索を実現している。核酸、アミノ酸を入力とし核酸、アミノ酸データベースに対する検索が行える。 |
| Categories | 処理要素別 > 探索する > 配列データベースから探索する > 配列類似性をもとに探索する > ホモロジー検索 > ホモロジー検索(核酸配列 対 核酸配列DB) 処理要素別 > 探索する > 配列データベースから探索する > 配列類似性をもとに探索する > ホモロジー検索 > ホモロジー検索(核酸配列の翻訳 対 タンパク質配列DB) 処理要素別 > 同定/予測する > ゲノム配列構造を同定/予測する > 遺伝子コード領域を同定/予測する > 転写産物配列比較により遺伝子コード領域を同定/予測する > ホモロジー検索(核酸配列 対 核酸配列DB) 処理要素別 > 同定/予測する > ゲノム配列構造を同定/予測する > 遺伝子コード領域を同定/予測する > 転写産物配列比較により遺伝子コード領域を同定/予測する > ホモロジー検索(核酸配列の翻訳 対 タンパク質配列DB) 分野別 > ゲノム解析 > 比較ゲノム解析 > チンパンジーとヒトの比較ゲノム解析 > Step2 チンパンジーとヒトゲノムのアライメント(2) 文献別 > ニワトリゲノム解読(ゲノム解析) > 組織別発現遺伝子の同定 > ESTマッピング 文献別 > ニワトリゲノム解読(ゲノム解析) > 組織別発現遺伝子の同定 > ESTマッピング 文献別 > チンパンジーゲノム解読(ゲノム解析) > チンパンジーとヒトの比較ゲノム解析 > チンパンジーとヒトゲノムのアライメント(2) 文献別 > ラットゲノム解読(ゲノム解析) > 配列アセンブリング > ゲノムマップ構築 文献別 > ラットゲノム解読(ゲノム解析) > 遺伝子領域予測 > 遺伝子領域モデル作成 > 遺伝子領域予測 |
| Websites | UCSC |
| Reference | BLAT--the BLAST-like alignment tool. PubMed ID: 11932250 |