| RNA Secondary structure prediction | |
| Resource Name | RNA Secondary structure prediction |
| Other Names | - |
| Description | 1本の配列もしくは複数配列のマルチプルアライメントを入力として受け付ける2次構造予測サーバー。前者の場合には自由エネルギー最小となる構造を探索する。後者の場合には、進化的考察から、連続して塩基対を形成する領域（同じ配列内部でアライメントされる領域）で相補的な塩基置換が起こっている箇所をCOMPENSATIONAL、さらにマルチプルアライメントにおいて保存されている箇所をCONSERVATIVEとしてスコアリングに加味し、グリーディーもしくはダイナミックプログラミング最適2次構造を探索する。 |
| Categories | |
| Websites | GeneBee |
| Reference | - |