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ClustalW
Resource Name ClustalW
Other Names -
Description 累進法によるマルチプルアライメントツール。NJ法により系統樹を作成し、その系統樹で距離が近い配列同士から累進法によってマルチプルアライメントに組み上げられて行く。入力された配列群の全ペアを対象としてペアワイズアライメントを行い距離行列を生成し、基にNJ法により系統樹を作成、系統樹の枝に沿ってペアワイズアライメント同士をアライメントすることにより最終的なマルチプルアライメントを生成する。
Categories
処理要素別 > 比較する > 配列を比較する > 3つ以上の配列を比較する > 3つ以上の配列の全領域を比較する > グローバルマルチプルアライメント
処理要素別 > 比較する > 生物種を比較する
処理要素別 > 分類する > 複数の配列を分類する > 配列間の類似性をもとに、分類する
分野別 > ゲノム解析 > アノテーション > コード領域予測 > 遺伝子コード領域を同定/予測する > Step6 多生物種間の転写産物配列の比較
分野別 > ゲノム解析 > 比較ゲノム解析 > multiple alignment of chimp chr22 genes with orthologs in other species > Step12
文献別 > チンパンジー22番染色体ゲノム解読 > multiple alignment of chimp chr22 genes with orthologs in other species > [ChimpChr22_Workflow_4_3]
文献別 > チンパンジーゲノム解読(ゲノム解析) > 遺伝子コード領域を同定/予測する > 多生物種間の転写産物配列の比較
文献別 > イヌゲノム解読(ゲノム解析) > ゲノム比較 > 多様度評価 > イヌ・ヒト・マウスのオーソロガスリピートの比較
文献別 > アカパンカビゲノム解読(ゲノム解析) > MFS糖輸送体系統解析 > マルチプルアライメント
文献別 > マラリア原虫ゲノム解読(ゲノム解析) > 進化解析 > ホモログのアライメント
文献別 > マラリア原虫ゲノム解読(ゲノム解析) > 進化解析 > 系統樹作成
Websites EBI NIG IGBMC
Reference CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice.
PubMed ID: 7984417