| 解析目的 | 遺伝子領域予測 |
| Arabidopsis_Workflow_1 |
| 解析目的 | Ab initio法により遺伝子領域を同定/予測する |
| Arabidopsis_Workflow_1_1 |
| | 解析目的 | Ab initio法により遺伝子領域を同定/予測する |
| | 入力データ | BAC配列 |
| | 処理内容/ 解析ツール | Genscan |
| | 出力データ | 配列アノテーション:遺伝子コード領域候補 |
| Arabidopsis_Workflow_1_2 |
| | 解析目的 | Ab initio法により遺伝子領域を同定/予測する |
| | 入力データ | BAC配列 |
| | 処理内容/ 解析ツール | GeneMark.hmm |
| | 出力データ | 配列アノテーション:遺伝子コード領域候補 |
| Arabidopsis_Workflow_1_3 |
| | 解析目的 | Ab initio法により遺伝子領域を同定/予測する |
| | 入力データ | BAC配列 |
| | 処理内容/ 解析ツール | Xgrail |
| | 出力データ | 配列アノテーション:遺伝子コード領域候補 |
| Arabidopsis_Workflow_1_4 |
| | 解析目的 | Ab initio法により遺伝子領域を同定/予測する |
| | 入力データ | BAC配列 |
| | 処理内容/ 解析ツール | Genefinder |
| | 出力データ | 配列アノテーション:遺伝子コード領域候補 |
| Arabidopsis_Workflow_1_5 |
| | 解析目的 | Ab initio法により遺伝子領域を同定/予測する |
| | 入力データ | BAC配列 |
| | 処理内容/ 解析ツール | GlimmerA |
| | 出力データ | 配列アノテーション:遺伝子コード領域候補 |
| Arabidopsis_Workflow_1_6 |
| | 解析目的 | Ab initio法によりスプライス部位を同定/予測する |
| | 入力データ | BAC配列 |
| | 処理内容/ 解析ツール | NetGene2 |
| | 出力データ | 配列アノテーション:スプライス部位候補 |
| Arabidopsis_Workflow_1_7 |
| | 解析目的 | Ab initio法によりスプライス部位を同定/予測する |
| | 入力データ | BAC配列 |
| | 処理内容/ 解析ツール | Splice Predictor |
| | 出力データ | 配列アノテーション:スプライス部位候補 |
| Arabidopsis_Workflow_1_8 |
| | 解析目的 | Ab initio法によりスプライス部位を同定/予測する |
| | 入力データ | BAC配列 |
| | 処理内容/ 解析ツール | GeneSplicer |
| | 出力データ | 配列アノテーション:スプライス部位候補 |
| Arabidopsis_Workflow_2 |
| 解析目的 | 転写産物構造比較により遺伝子コード領域を同定/予測する |
| Arabidopsis_Workflow_2_1 |
| | 解析目的 | 転写産物構造比較により遺伝子コード領域を同定/予測する |
| | 入力データ | BAC配列 |
| | データベース | ESTデータベース |
| | データベース | Arabidopsis gene index |
| | 処理内容/ 解析ツール | DDS/GAP2 |
| | 出力データ | 配列アノテーション:遺伝子コード領域候補 |
| Arabidopsis_Workflow_2_2 |
| | 解析目的 | 転写産物構造比較により遺伝子コード領域を同定/予測する |
| | 入力データ | BAC配列 |
| | データベース | ESTデータベース |
| | データベース | Arabidopsis gene index |
| | 処理内容/ 解析ツール | blastn |
| | 出力データ | 配列アノテーション:遺伝子コード領域候補 |
| Arabidopsis_Workflow_3 |
| 解析目的 | 手作業により遺伝子コード領域を同定/予測する |
| 入力データ | BAC配列 |
| 入力データ | 配列アノテーション:遺伝子コード領域候補 |
| 入力データ | 配列アノテーション:遺伝子コード領域候補 |
| 入力データ | 配列アノテーション:遺伝子コード領域候補 |
| 入力データ | 配列アノテーション:遺伝子コード領域候補 |
| 入力データ | 配列アノテーション:遺伝子コード領域候補 |
| 入力データ | 配列アノテーション:スプライス部位候補 |
| 入力データ | 配列アノテーション:スプライス部位候補 |
| 入力データ | 配列アノテーション:スプライス部位候補 |
| 入力データ | 配列アノテーション:遺伝子コード領域候補 |
| 入力データ | 配列アノテーション:遺伝子コード領域候補 |
| 処理内容/ 解析ツール | DIALIGN2 |
| 出力データ | 配列アノテーション:遺伝子コード領域候補 |
