| 解析目的 | ゲノム解析 |
| RiceChr1_Workflow_1 |
| 解析目的 | RiceGAAS遺伝子領域予測 |
| RiceChr1_Workflow_1_1 |
| | 解析目的 | Ab initio法により遺伝子領域を同定/予測する |
| | 入力データ | ゲノム配列 |
| | 処理内容/ 解析ツール | Genscan |
| | 出力データ | 遺伝子領域候補 |
| RiceChr1_Workflow_1_2 |
| | 解析目的 | Ab initio法により遺伝子領域を同定/予測する |
| | 入力データ | ゲノム配列 |
| | 処理内容/ 解析ツール | Genscan |
| | 出力データ | 遺伝子領域候補 |
| RiceChr1_Workflow_1_3 |
| | 解析目的 | Ab initio法により遺伝子領域を同定/予測する |
| | 入力データ | ゲノム配列 |
| | 処理内容/ 解析ツール | RiceHMM |
| | 出力データ | 遺伝子領域候補 |
| RiceChr1_Workflow_1_4 |
| | 解析目的 | Ab initio法により遺伝子領域を同定/予測する |
| | 入力データ | ゲノム配列 |
| | 処理内容/ 解析ツール | MZEF |
| | 出力データ | 遺伝子領域候補 |
| RiceChr1_Workflow_1_5 |
| | 解析目的 | 転写産物構造比較により遺伝子コード領域を同定/予測する |
| | 入力データ | ゲノム配列 |
| | 処理内容/ 解析ツール | blastn |
| | 出力データ | 遺伝子領域候補 |
| RiceChr1_Workflow_1_6 |
| | 解析目的 | 転写産物構造比較により遺伝子コード領域を同定/予測する |
| | 入力データ | ゲノム配列 |
| | 処理内容/ 解析ツール | blastx |
| | 出力データ | 遺伝子領域候補 |
| RiceChr1_Workflow_1_7 |
| | 解析目的 | 手作業により遺伝子コード領域を同定/予測する |
| | 入力データ | 遺伝子領域候補 |
| | 入力データ | 遺伝子領域候補 |
| | 入力データ | 遺伝子領域候補 |
| | 入力データ | 遺伝子領域候補 |
| | 入力データ | 遺伝子領域候補 |
| | 入力データ | 遺伝子領域候補 |
| | 処理内容/ 解析ツール | 遺伝子領域候補の結合 |
| | 出力データ | 遺伝子領域候補 |
| RiceChr1_Workflow_1_8 |
| | 解析目的 | リピート領域を予測する |
| | 入力データ | ゲノム配列 |
| | 処理内容/ 解析ツール | RepeatMasker |
| | 出力データ | リピート領域候補 |
| RiceChr1_Workflow_2 |
| 解析目的 | タンパク質機能予測 |
| RiceChr1_Workflow_2_1 |
| | 解析目的 | 翻訳 |
| | 入力データ | 遺伝子領域候補 |
| | 処理内容/ 解析ツール | 翻訳 |
| | 出力データ | タンパク質配列 |
| RiceChr1_Workflow_2_2 |
| | 解析目的 | 機能予測 |
| | 入力データ | タンパク質配列 |
| | データベース | InterPro |
| | 処理内容/ 解析ツール | InterProScan |
| | 出力データ | タンパク質機能 |
| RiceChr1_Workflow_2_3 |
| | 解析目的 | 機能予測 |
| | 入力データ | タンパク質配列 |
| | データベース | 非冗長タンパク質配列データベース |
| | 処理内容/ 解析ツール | blastp |
| | 出力データ | MIPSタンパク質機能カテゴリ |
